新冠病毒Delta变异的相关问题:疫苗有用吗?
时间:2021-08-06 来源:新闻网 人浏览 -
冠状病毒是有包膜的正链RNA病毒。2019年爆发的新型冠状病毒属于β属冠状病毒,与SARS病毒及一些蝙蝠冠状病毒属于相同亚属、不同进化枝。
一,冠状病毒的变异性如何?病毒的演变可以通过多个方式进行。
抗原漂移(antigenic drift):病毒在体内复制时,面对免疫压力下,病毒抗原的微小变异;通常是病毒基因的点突变,或者缺失突变所致。
抗原转换(antigenic shift):抗原的突发性的巨大改变。通常认为是病毒基因重组的结果,但也有人认为可能是病毒基因点突变的量变引发的质变。
根据大量的数据分析,新冠病毒的突变速度并不快。不仅仅是新冠病毒,大多数冠状病毒的突变速度在RNA病毒大家族里也算是慢的,因为冠状病毒存在RNA校正酶。且冠状病毒的基因是一段很长的RNA链,而不像一些RNA病毒是分段方式。
目前已知的常见病毒里,HIV病毒的变异性是最强的;甲型流感病毒的变异性也相对强。冠状病毒(包括这次的新冠病毒)的变异性相对弱很多。
(本内容参考、学习并大量引用了“庄时利和”先生的微博内容)
二,目前值得注意的新冠病毒变异有哪些?目前已发现的且相对重要的新冠病毒变异有如下:
1,Alpha(B.1.1.7变异株):
2020年末在英国首次发现。该变异株含有超过十几种突变,一些突变位于刺突蛋白。变异的主要特征是强化了传播性;毒性似乎也有增强,但并不是很突出。
B.1.1.7的另一种突变是刺突蛋白氨基酸69-70缺失(del 69-70)。存在此缺失时,一些新冠病毒的分子检测不能检出S基因(编码刺突蛋白)靶点。这可能导致漏诊。但通常,我们做PCR检测时,会同时检测多个基因靶点,因此漏诊的可能性不大。但漏诊的可能性有所增加。
2,Beta(B.1.351变异株)
2020年末在南非发现。该变异病毒株存在刺突蛋白的另一种突变(E484K)。其特征是增加了传播性,毒性。已上市的mRNA疫苗的保护效能对该变异病毒相对下降。
3,Gamma (P.1变异株)
先是从几个日本到巴西旅行返回后测出,2020年12月于巴西亚马逊州测序的31份样本中,42%发现此变异株感染。
P.1有几种突变,包括位于刺突蛋白受体结合结构域的3种突变,即N501Y、E484K和K417T,因此有人认为其可能会增加传播率和影响免疫力。
4,Delta (B.1.617.2 变异株)
于2020年12月在印度首次发现;该变异可能是到2021年8月4日为止最强传播性的新冠病毒变异株。
Delta感染相关的二次家庭感染率为13.6%,而Alpha感染率为9.0%[1];而且,其重症概率更高[1]。在另一份关于美国小规模爆发的报告里,该病毒株的家庭发病率为53%[2]。
一项未发表的关于中国爆发的研究表明(今年广州疫情期间)[3],Delta的初始呼吸道病毒RNA水平比在大流行第一阶段传播的祖先病毒高1260倍。
5,其他变异
目前还有Epsilon (B.1.427 and B.1.429变异株)等。因为目前影响力相对不大,这里不展开讨论。
冠状病毒外观
三,新冠病毒Delta变异的进一步讨论1,来自中国广州疫情的报告
中国广州市在今年5月底爆发了一次新冠疫情。它是由新冠病毒Delta变异株引起。
针对这次疫情的未正式发表的研究报告发现如下特征[3]:
与2020年早期在中国流行的原始毒株相比,Delta感染导致的病毒载量平均提高了1260倍。 2020年原始毒株感染者在首次核酸检测阳性时,平均的Ct值是34.31;而广州疫情的感染者,平均Ct值上升至24.00。(Ct值=Cycle threshold,是核酸检测(rt-PCR)的循环阈值,数字越低代表病毒载量越高)在首次核酸检测阳性时,19.05%的原始毒株感染者口咽拭子病毒载量>6×10e5 copy/ml;而Delta感染者身上,这个数字上升至80.65%。Delta感染者从接触病毒到能被检测出来的时间窗口,大约只有3.7天(相对比,2020年的原始毒株是7天);并且与原始毒株相比,Delta感染者首次核酸检测阳性时传播风险更高。(本段内容参考并引用了“庄时利和”先生微博里对该研究的解读)
2,来自美国CDC对新冠病毒Delta变异株的研究PPT内容
就传播能力来说,原始新冠病毒的R0在1-3之间,现在Delta变异株的R0在5-9之间。
也就是说,新冠病毒Delta变异株比1918年西班牙大流感和天花更强,可以跟水痘病毒媲美。
新冠病毒Delta变异株的病毒负载比alpha变种增加约10倍,引起的爆发规模也大些,病情持续的时间也从从13天延长到18天。
请注意,这里的10倍是跟alpha变种做对比。而中国广州的1260倍那个是跟新冠原始病毒做对比。
同时,流行病学家Osterholm 博士说1000倍的病毒载量相当于增加1倍的传染率,没有听起来那么吓人。
不排除这个可能:接种疫苗后(mRNA疫苗,因为美国没上市中国疫苗),如仍感染了新冠病毒Delta变异株,那该感染者仍有传播性。但目前尚无定论。
但是,可以肯定地说,接种新冠疫苗者的病死率下降了。在英国,2020年4月的时段病死率曾经在5%上下,甚至更高。但是,英国2021年7月的时段病死率却只有0.1%左右。
(本段内容主要参考了微博好友 “阿司匹林42195米”先生的微博内容)
3,疫苗与新冠病毒
在今年的一项研究里,以色列完成疫苗接种的1497名医务工作者接受了新冠病毒PCR检测;他们中发现了39例(0.4%)确诊感染者[4]。
不久前,新英格兰杂志发表的一项随访和追踪英国4000例最近感染病例的研究[5]:发现辉瑞疫苗(BNT162b2)两剂接种后对Delta突变株保护力为88%(有症状感染),对Alpha为94%。阿斯利康疫苗(AZD1222)两剂接种对Delta保护力为67%,对Alpha为75%。
(以上参考并引用了 “子陵在听歌”先生的微博内容)
新加坡国家传染病研究中心在medRxiv上传了一篇新冠病毒Delta突变株的研究报告[6]。该研究囊括了218名感染了Delta变种的人。其中71人完成了mRNA疫苗接种,还有130人没有接种过疫苗。
①有感染的症状:
— 接种后感染的人病情更轻,超过四分之一的人(28.2%)表现为无症状感染,
— 而未接种的人只有不到十分之一(9.2%)是无症状感染。
②有症状的病人里:
— 接种后感染的人,出现的症状比未接种的人要少。
— 未接种的人,更多发展成肺炎、更需要供氧、更多人需进ICU(重症监护室)。
③通过给这些病人连续做核酸测试,他们发现打了疫苗的人CT值上升得更快,表示病毒清除更快。
④同时,接种后病人的中和抗体上升也更快。可能是接种疫苗后,免疫细胞产生了记忆,一碰到病毒就迅速投入战斗。
所以,新加坡的研究揭示:即使同被Delta感染,即使CT值相似,打过疫苗的人症状更轻、病毒下降更快,因而他们再传染别人的可能性也更低。(本段内容引用自“阿司匹林42195米”先生的微博内容)
来自今年7月,美国新闻媒体NBC的报道:美国38个州125682例“接种疫苗后感染了新冠病毒”,请注意,对应的是1.642亿人完成疫苗接种;其中1400人死亡。也就是说,0.08%的疫苗接种者感染了新冠病毒。
但这里没有具体定义什么叫感染者。比如上面提到的以色列采用PCR检测到病毒即为感染者。但有些研究里,只有「有症状者」才会被检测。这样的大规模事后调研的数据是混杂的。于是就有这样的数据差异:以色列的医师团体接种疫苗后的感染率是0.4%,而NBC的报道为0.08%。
四,最终总结:我们该怎么办?新冠病毒Delta变异株的传播性更强了。其病死率也较原始病毒株更为厉害。
但是,针对新冠病毒的已上市mRNA疫苗有较好的保护效能。只有很少数的疫苗接种者会被新冠病毒Delta变异株感染。接种疫苗后的病死率也较低,症状相对轻,脏器损伤相对不明显。(由于笔者没有查到国产疫苗的具体研究报告数据,本篇相关内容缺失。但初步了解到,国产灭活疫苗也有相似的保护效能)
在有疫苗的情况下,常规的社交隔离策略对预防新冠病毒Delta变异株感染仍很重要。因为没有疫苗可以100%杜绝被感染。
有了社交隔离策略,我们也不能因此否定疫苗的价值。疫苗接种可以很大程度上帮助我们预防被感染,预防感染后重症,预防感染后病死。
社交隔离+疫苗接种,双管齐下。这才是控制新冠病毒感染的有力措施。
致谢:
感谢微博网友:庄时利和、子陵在听歌、阿司匹林42195米等先生的专业微博内容。通过他们,我学习到很多关于新冠病毒等医学知识。
参考文献:
1,https://assets.publishing.service.gov.uk/government/uploads/system/uploads/attachment_data/file/991343/Variants_of_Concern_VOC_Technical_Briefing_14.pdf (Accessed on June 07, 2021).
2,Dougherty K, Mannell M, Naqvi O, et al. SARS-CoV-2 B.1.617.2 (Delta) Variant COVID-19 Outbreak Associated with a Gymnastics Facility - Oklahoma, April-May 2021. MMWR Morb Mortal Wkly Rep 2021; 70:1004.
3,Viral infection and transmission in a large well-traced outbreak caused by the Delta SARS-CoV-2 variant - SARS-CoV-2 coronavirus / nCoV-2019 Genomic Epidemiology - Virological
4,Moriah Bergwerk, M.B., B.S.,Tal Gonen, B.A, et al.Covid-19 Breakthrough Infections in Vaccinated Health Care Workers.N Engl J Med 2021
5,Jamie Lopez Bernal, F.F.P.H., Ph.D.,et al.Effectiveness of Covid-19 Vaccines against the B.1.617.2 (Delta) Variant.N Engl J Med 2021
6,PoYing Chia,MBBS;Sean WeiXiang Ong,MBBS,et al.Virological and serological kinetics of SARS-CoV-2 Delta variant vaccine- breakthrough infections: a multi-center cohort study
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